Nhuộm Feulgen nhằm phát hiện ADN, nên nhờ phương pháp này mà nhà nghiên cứu xác định được chính xác cấu trúc có ADN trong tế bào và mô. Cũng vì thế, nó được áp dụng phổ biến để nghiên cứu bộ nhiễm sắc thể của các loài sinh vật.
Ngoài ra, có thể sử dụng phản ứng Feulgen như một kỹ thuật định lượng tương đối ADN, nhờ đó có thể phân biệt tế bào tứ bội với tế bào lưỡng bội, tế bào đơn bội với tế bào lưỡng bội,... và nhất là định lượng tương đối ADN trong các giai đoạn khác nhau (G1, S và G2) của chu kỳ tế bào.[4][5]
